Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
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