Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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