Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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