Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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