Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTF1Q16619 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms