Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGCAQ16586 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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SGCAQ16586 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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