Protein–RNA interactions for Protein: Q16514

TAF12, Transcription initiation factor TFIID subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF12Q16514 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF12Q16514 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF12Q16514 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF12Q16514 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF12Q16514 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF12Q16514 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF12Q16514 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF12Q16514 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF12Q16514 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF12Q16514 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF12Q16514 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF12Q16514 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF12Q16514 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF12Q16514 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF12Q16514 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF12Q16514 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms