Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZNF56Q15929 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms