Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NEDD8Q15843 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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