Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CST6Q15828 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CST6Q15828 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CST6Q15828 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CST6Q15828 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CST6Q15828 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CST6Q15828 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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CST6Q15828 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CST6Q15828 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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CST6Q15828 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CST6Q15828 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CST6Q15828 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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CST6Q15828 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CST6Q15828 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CST6Q15828 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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CST6Q15828 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CST6Q15828 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CST6Q15828 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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CST6Q15828 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CST6Q15828 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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CST6Q15828 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CST6Q15828 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CST6Q15828 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CST6Q15828 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CST6Q15828 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CST6Q15828 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CST6Q15828 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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CST6Q15828 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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CST6Q15828 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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CST6Q15828 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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CST6Q15828 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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CST6Q15828 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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CST6Q15828 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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