Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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