Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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SYCP1Q15431 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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SYCP1Q15431 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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