Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 OARD1-214ENST00000486443 764 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 SNRPN-208ENST00000577565 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 PSME3-213ENST00000592169 826 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC022784.6-203ENST00000520255 863 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 MIR6741-201ENST00000618782 63 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 CTLA4-201ENST00000295854 525 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RYR3Q15413 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.83
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