Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLD3Q15054 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms