Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 ETFRF1-207ENST00000556351 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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LAPTM4AQ15012 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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