Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms