Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms