Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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