Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMB3Q13751 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms