Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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PTCH1Q13635 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTCH1Q13635 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
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