Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CDH18Q13634 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CDH18Q13634 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CDH18Q13634 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CDH18Q13634 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CDH18Q13634 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CDH18Q13634 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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CDH18Q13634 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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CDH18Q13634 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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CDH18Q13634 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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CDH18Q13634 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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CDH18Q13634 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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