Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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CUL1Q13616 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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CUL1Q13616 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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CUL1Q13616 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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CUL1Q13616 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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CUL1Q13616 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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CUL1Q13616 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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