Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms