Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
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