Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms