Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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NR5A1Q13285 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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NR5A1Q13285 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR5A1Q13285 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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