Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BNIP1Q12981 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BNIP1Q12981 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BNIP1Q12981 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BNIP1Q12981 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BNIP1Q12981 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BNIP1Q12981 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BNIP1Q12981 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
BNIP1Q12981 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BNIP1Q12981 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BNIP1Q12981 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms