Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms