Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms