Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms