Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms