Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PAX8Q06710 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms