Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms