Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms