Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPCQ03188 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms