Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
XPCQ01831 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
XPCQ01831 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
XPCQ01831 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
XPCQ01831 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
XPCQ01831 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
XPCQ01831 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
XPCQ01831 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
XPCQ01831 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
XPCQ01831 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
XPCQ01831 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XPCQ01831 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
XPCQ01831 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
XPCQ01831 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
XPCQ01831 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
XPCQ01831 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XPCQ01831 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
XPCQ01831 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XPCQ01831 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
XPCQ01831 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XPCQ01831 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
XPCQ01831 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XPCQ01831 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XPCQ01831 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XPCQ01831 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
XPCQ01831 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XPCQ01831 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
XPCQ01831 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
XPCQ01831 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
XPCQ01831 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
XPCQ01831 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XPCQ01831 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XPCQ01831 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
XPCQ01831 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XPCQ01831 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XPCQ01831 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
XPCQ01831 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XPCQ01831 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XPCQ01831 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XPCQ01831 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XPCQ01831 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XPCQ01831 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XPCQ01831 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XPCQ01831 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XPCQ01831 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XPCQ01831 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XPCQ01831 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XPCQ01831 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XPCQ01831 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XPCQ01831 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XPCQ01831 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XPCQ01831 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XPCQ01831 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XPCQ01831 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XPCQ01831 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XPCQ01831 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XPCQ01831 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms