Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP1Q00587 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms