Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms