Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms