Protein–RNA interactions for Protein: P81408

FAM189B, Protein FAM189B, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM189BP81408 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM189BP81408 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms