Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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