Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SH3BGRP55822 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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