Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIRAP54198 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIRAP54198 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms