Protein–RNA interactions for Protein: P49918

CDKN1C, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1CP49918 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKN1CP49918 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms