Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF6P49848 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF6P49848 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF6P49848 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 613.4 ms