Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP4P49662 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP4P49662 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP4P49662 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP4P49662 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP4P49662 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP4P49662 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP4P49662 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP4P49662 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP4P49662 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CASP4P49662 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CASP4P49662 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP4P49662 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP4P49662 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP4P49662 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP4P49662 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP4P49662 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP4P49662 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP4P49662 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP4P49662 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP4P49662 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP4P49662 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP4P49662 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP4P49662 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP4P49662 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP4P49662 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP4P49662 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP4P49662 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP4P49662 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP4P49662 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP4P49662 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP4P49662 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP4P49662 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP4P49662 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP4P49662 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP4P49662 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP4P49662 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP4P49662 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP4P49662 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP4P49662 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP4P49662 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP4P49662 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP4P49662 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASP4P49662 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASP4P49662 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP4P49662 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP4P49662 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP4P49662 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP4P49662 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP4P49662 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP4P49662 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP4P49662 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASP4P49662 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms