Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSBP45954 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms