Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms