Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPD2P43304 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD2P43304 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GPD2P43304 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GPD2P43304 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GPD2P43304 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GPD2P43304 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GPD2P43304 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GPD2P43304 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD2P43304 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms