Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBRP36941 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBRP36941 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBRP36941 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBRP36941 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBRP36941 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBRP36941 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBRP36941 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBRP36941 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBRP36941 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBRP36941 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBRP36941 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBRP36941 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBRP36941 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBRP36941 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBRP36941 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBRP36941 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBRP36941 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBRP36941 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBRP36941 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBRP36941 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBRP36941 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBRP36941 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBRP36941 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LTBRP36941 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LTBRP36941 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms